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SNP基因分型检测技术服务

服务编号：BIOFW102

服务简介

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)，即染色体基因组中单个核苷酸的突变而引起的 DNA 序列的多态性，它以单个碱基的颠换、转换、插入和缺失等形式存在。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种，即转换和颠换,二者之比为2：1。SNP 在CG序列上出现较为频繁，而且多是C转换为T，原因是CG中的胞嘧啶常被甲基化,而后自发地脱氨成为胸腺嘧啶。一般而言，SNP 是指变异频率大于1 %的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP，人类基因组上的SNP总量大概是3×10^6个。因此，SNP成为遗传标志，人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。

SNP研究是人类基因组计划走向应用的重要步骤。大量存在的SNP位点，使人们有机会发现与各种疾病，包括肿瘤相关的基因组突变。研究发现，人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都与SNP有关。

基于过硬的引物合成及标记技术，多重PCR扩增技术，测序技术，本公司推出多种SNP分型服务的方法：直接测序方法、多重SNaPshot SNP方法、以及Taqman探针设计合成，为广大客户提供多样的选择。涵盖了对血液、组织、口腔、细菌、真菌样品gRNA提取及分型技术服务。

常用方法

1 直接测序法

技术原理：将待检测片段进行PCR扩增并直接测序，是SNP检测方法中准确的方法。纯合位点为单峰，而杂合峰为套峰，因而很容易将几种基因型区分开来。直接测序法不仅可用于对已知位点的检测，还可用于发现未知的SNP位点。

2 KASP分型法

技术原理：KASP（Kompetitive Allele Specific PCR，竞争性等位基因特异性PCR）只需要设计并合成普通扩增引物，并利用分别带有FAM、HEX或BHQ1修饰的通用探针引物即可实现对基因多态性位点的检测。该方法不仅可以检测SNP多态性位点，对插入缺失和特定的基因组中甲基胞嘧啶都可以实现检测。该方法不仅缩短了基因多态性检测周期，同时也大大降低了检测成本。

3 连接酶检测反应（LDR）分型方法

技术原理：主要应用连接酶检测反应（（igase detection reaction，LDR）技术。即在Taq DNA连接酶的作用下，当左右两条索核苷酸探针与目的DNA序列完全互补，并且两条探针之间没有空障时才能发生连接反应，否则连接反应不能进行，通过荧光扫描片段长度，实现对SNP位点的检测。

4 多重SNaPshot SNP分型方法

技术原理：SNaPshot SNP分型是一种以单碱基延神原理为基础，同时利用多重PCR对多个已知SNP位点进行遗传分型的方法。在一个含有测序酶，四种荧光标记的ddNTP，紧挨多态位点5'端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中，引物延伸一个碱基即终止，经测序仪跑胶后，根据峰的颜色可知掺入的碱基种类，从而确定该样本的基因型，根据峰移动的胶位置确定该延伸产物对应的SNP位点。

5 Taqman 探针方法

技术原理：在PCR反应系统中加入2种不同荧光标记的探针，它们可分别与2个等位基因完全配对。正常情况下，由于探针5'端荧光基团和3端淬灭基团紧邻在一起，荧光被淬灭。随着PCR的有效进行，与模板完全配对的探针逐步被Taq DNA聚合酶5'-→3'外切酵活性切割，致使探针5端上的荧光基团与3'端的淬灭基团分离，淬灭效应解除，报告荧光基团被激活；而与模板不能完全配对的探针（代表另一种等位基因）不能被有效切割，故检不到荧光信号，通过相应仪器检测荧光值的变化即可实现SNP位点检测。

应用领域

l 表型变异/疾病遗传机制研究

l 复杂疾病易感基因定位

l 基因检测

l 个体化治疗

l 特定人群的遗传分析，人群进化史研究

服务优势

百欧泰团队具有成熟检测经验，可提供多种服务优势：

l 分型准确，其准确度达99.9%；

l 可多位点同时检测；

l 不受SNP位点多态特性限制；

l 不受样品个数的限制；

l 专业性强：可根据客户实验具体分析，满足不同的实验需求，提供多种文库构建服务；

l 专业的技术支持，保障强力、周到的售前售后服务支持，随时为您解答出现的任何问题。

服务流程

双方沟通一致后确定实验方案，确定服务要求-签订合同—预付款-开始实验-成果交付

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